Rojen je bil 24. 4. 1860 v Rihemberku. Osnovno šolo je obiskoval v domači vasi, gimnazijo in bogoslovje pa v Gorici. Za duhovnika je bil posvečen leta 1884. Najprej je kot kaplan služboval v Ročinju, zatem pa v Sveti Luciji. Od tu je šel v Čepovan in se kmalu spet vrnil k Sv. Luciji, kjer je župnikoval do smrti. 1916. leta ga je zadela laška granata in je umrl v vojni bolnišnici v Klavžah. Pokopali so ga v Podmelcu.
Jožef Fabijan se je trudil za kulturni in gospodarski napredek. Ustanovil je izobraževalno društvo Soča ter Kmečko hranilnico in posojilnico leta 1908.
Ivanu Preglju je bil mecen in mentor. Po smrti Pregljevih staršev mu je bil krušni in duhovni oče. Poslal ga je študirat v Gorico in ga denarno podpiral. Vpeljal ga je v krog sodelavcev Mohorjeve družbe in mu tako omogočil, da je postal eden vodilnih slovenskih pisateljev katoliškega kroga. Pregelj mu je zato vse življenje ohranil hvaležen spomin ter ga je večkrat omenjal v svojih spisih.
1922. leta so v Podmelcu prekopali njegovo truplo in ga prenesli k Sv. Mavru na Most na Soči, kjer je pokopan še danes.
Iz Kronike fare sv. Lucije na Mostu citiramo tiste zapise, ki pričajo o tem, kako je Jožef Fabijan podpiral Ivana Preglja:
– G. Fabijan je prispeval za dijaka Ivana Preglja 107,55 gld v letu 1898. (str. 236)
– 12. 8. 1898 je župnik Fabijan dal priporočilo Ordinarjatu za sprejem Ivana Preglja v Andrejišče. (str. 236)
– Leta 1899 župnik Fabijan spet prosi za sprejem Ivana Preglja v šole: Gre za nadebudnega fanta, ki bo nekoč delal čast zavodu – priporoča ga ponovno, tudi če bo treba – proti celotnemu vplačilu – 100 kron mesečno. (str. 237)
– V letih od 1904–1906 je župnik Fabijan podpiral in delal načrte za domačega pesnika in pisatelja Ivana Preglja. Iz goriških šol je šel študirat na Dunaj. (str. 246)
– Pisatelj Pregelj piše župniku Fabijanu iz Kranja o beguncih, ki prihajajo na Gorenjsko leta 1916. (str. 255)