Od prvih let delovanja muzeja v Tolminu predstavljajo velik del obiskovalcev šolske skupine, ki zahtevajo posebno pozornost in prilagojen način vodenja.
V ta namen se v muzeju že vrsto let organizira in izvaja raznovrstna pedagoška in andragoška dejavnost, s katero se poskuša na razstavah predstavljene vsebine čim bolje predstaviti vsem, ki si žele dodatnih informacij in znanj. Z vrtci in osnovnimi ter srednjimi šolami tudi sicer pogosto sodelujemo: gostimo njihove razstave in dogodke, kot mentorji ali predavatelji sodelujemo pri njihovem učnem procesu in raziskovalnih projektih, vključujemo jih v naše muzejske dogodke, pomagamo jim z našim knjižničnim in arhivskim gradivom.
Drug pomemben del izobraževalnih aktivnosti muzeja pa predstavlja založniška dejavnost. Tolminski muzej namreč vsako leto izda najmanj eno strokovno ali poljubno monografsko publikacijo, v kateri predstavlja izsledke svojega dela in zgodovino ter dogajanje na območju, ki ga pokriva. Zaposleni v muzeju poleg tega veliko objavljajo še v monografskih in serijskih publikacijah drugih ustanov, vedno bolje pa je muzejsko delo predstavljeno tudi na spletnih straneh Tolminskega muzeja.