Enota v Novem mestu je bila ustanovljena leta 1973. Njena osnovna naloga je, da zbira, hrani ter strokovno obdeluje javno in zasebno arhivsko gradivo, ki je zaščiten kulturni spomenik narodne identitete. Arhiv daje gradivo v uporabo javnosti v svoji čitalnici in sprejemni pisarni. Pod njegovo pristojnost spadajo območja upravnih enot Črnomelj, Metlika, Novo mesto in Trebnje. Arhiv hrani približno 1500 tekočih metrov arhivskega gradiva v 500 arhivskih fondih. Novomeški arhivisti poleg tega promovirajo svojo dejavnost z organizacijo šolskih ur v arhivu in s pripravo zgodovinskih razstav.