Prva znana omemba Zbilj datira v leto 1341.
Obstaja zgodba, da je vas prvotno stala kakšen kilometer severneje. Nekoč je pogorela in je niso obnovili. Njeni prebivalci so se naselili tam, kjer vas stoji danes. V vasi stoji cerkev sv. Janeza Krstnika posvečena leta 1496 in na novo sezidana leta 1883. Po zajezitvi reke Save zaradi hidroelektrarne v Medvodah, se je vas uspešno usmerila v razvoj turizma.