Bogato gradivo in uspešno delovanje, izboljšani prostorski pogoji ter ugodna politična in splošna družbena klima so bili predpogoji za ponovno osamosvojitev tolminske muzejske zbirke. Do nje je prišlo leta 2000 z ustanovitvijo Tolminskega muzeja, katerega delovanje obsega občine Bovec, Kobarid in Tolmin.
Novo vodstvo in zaposlitev dodatnih strokovnih delavcev je dalo tolminskemu muzejskemu delu nov zagon. Leta 2003 je bila v dveh nadstropjih povsem prenovljenega Coroninijevega dvorca, ki je bil v celoti namenjen muzeju, postavljena obsežna stalna razstava Naplavine obsoške zgodovine. V pritličju stavbe so bili urejeni prostori za občasne razstave in poročna dvorana, v podstrešnih prostorih pa pisarne in bogata muzejska knjižnica. Kot zadnja pa je bila v kletnih prostorih odprta še razstava umetnostnozgodovinska razstava.
