V času, ko je na trgu zrasel samostan, so ob njem zgradili tudi cerkev. Ta je stala na mestu, kjer se danes trg Sv. Antona razširi. Bila naj bi kar velika, saj je v njeni kripti zadnje počivališče našla večina goriških plemiških družin. Leta 1753 so cerkev, po rušenju konec 17. stoletja, ponovno pozidali, vendar je bila manj kot sto let kasneje, leta 1817 dokončno porušena.